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Firmas genéticas de células T residentes en tejidos como herramienta predictiva para pacientes con melanoma

7 May 2024
Firmas genéticas de células T residentes en tejidos como herramienta predictiva para pacientes con melanoma

Un amplio estudio analítico realizado en el Instituto Terasaki de Innovación Biomédica (TIBI) ha revelado una asociación entre los resultados favorables de supervivencia de los pacientes con melanoma y la presencia de poblaciones más elevadas de células T con memoria residentes en los tejidos (TRM).

Los datos obtenidos en este estudio podrían utilizarse no sólo para un modelo de aprendizaje automático basado en las TRM con poder predictivo para el pronóstico del melanoma, sino también para dilucidar el papel que pueden desempeñar las células TRM en el microentorno inmunitario tumoral.

Esto podría guiar el desarrollo de regímenes de tratamiento inmunoterapéutico antitumoral más eficaces y personalizados para los pacientes con cáncer.

El microambiente inmunitario tumoral (MIT) hace referencia a la compleja y dinámica interacción entre las células tumorales, diversas células inmunitarias y otros componentes celulares y no celulares dentro del tumor y en torno a él.

Las células TRM son un tipo único de células inmunitarias que residen en los tejidos periféricos y en muchos tipos de cáncer.

Debido a la presencia y a las propiedades funcionales de las células TRM dentro del TIEMPO en el aprovechamiento de su potencial para la inmunoterapia del cáncer, ha habido mucho interés en estudiar las células TRM y cómo influyen en la supervivencia de los pacientes.

La clave para esta comprensión es establecer si la presencia y abundancia de células TRM en pacientes con cáncer se correlaciona con un mejor pronóstico de los pacientes. Los estudios previos realizados con pacientes de melanoma han arrojado resultados contradictorios.

Tampoco ha habido muchos esfuerzos por realizar un estudio exhaustivo para evaluar la abundancia de TRM y correlacionar los datos inmunómicos con los resultados de supervivencia de los pacientes.

El equipo del TIBI trató de resolver este problema recurriendo a los datos de la secuenciación de ARN unicelular (scRNA-seq), una potente tecnología que permite obtener un perfil genético completo de un gran número de células individuales.

En lugar de utilizar un número limitado de genes marcadores identificadores de una célula, la utilización de la tecnología scRNA-seq proporciona una forma más completa, precisa y matizada de caracterizar el tipo y la función de una célula.

A partir de este perfil, pueden generarse firmas génicas, patrones característicos únicos de un tipo específico de célula inmunitaria que posiblemente puedan correlacionarse con la presencia de una enfermedad.

Como describen en su reciente artículo en iScience, el equipo utilizó este enfoque en dos cohortes independientes de datos scRNA-seq de pacientes con melanoma y pudo extraer 11 firmas génicas distintas que guardaban una alta correlación con la abundancia de TRM en los pacientes.

También se encontró una sólida asociación entre estas firmas génicas y los resultados de supervivencia de los pacientes.

Otros estudios revelaron correlaciones positivas adicionales entre la abundancia de TRM y la presencia de múltiples células inmunitarias antitumorales en el TIEMPO del melanoma, así como con vías inmunitarias y genes reguladores, lo que sugiere que las células TRM tienen un papel crucial en la inmunomodulación.

Los estudios también indicaron que una abundancia de células TRM se traduce en un TIEMPO de melanoma más activo y en mejores resultados para los pacientes.

Por último, los investigadores del TIBI podrían utilizar los datos de su análisis para crear un sistema de puntuación del riesgo derivado de las TRM de alta precisión para clasificar a los pacientes en categorías de pronóstico de alto y bajo riesgo para los pacientes con melanoma.

«El enfoque analítico de nuestros científicos y sus descubrimientos sobre el papel que desempeñan las células TRM pueden ayudar a perfeccionar y evaluar con mayor precisión la respuesta de los pacientes con cáncer a los fármacos inmunoterapéuticos», declaró Ali Khademhosseini, director y consejero delegado del TIBI. «Dado que los tratamientos pueden tener efectos profundamente variables en cada paciente de cáncer, éste es un paso importante para mejorar los resultados de los pacientes».

Fuente: Instituto Terasaki de Innovación Biomédica